煉金術(shù)師愛(ài)德華德和他的弟弟阿爾芬斯因十分思念在他們還小的時(shí)候亡故的母親，實(shí)行了煉金術(shù)中最大的禁忌--可以將死者復(fù)活的人體煉成?？墒菬挸墒?，愛(ài)德華德失去了左腿，阿爾芬斯則失去了全身。愛(ài)德華德好不容易才以犧牲自己的右臂為代價(jià)將弟弟的靈魂煉成，并定著在一副鎧甲上，可是其代價(jià)未免太大了。愛(ài)德華德和阿爾芬斯一起，為了找回所失去的一切，開(kāi)始踏上了尋找擁有極大力量的“賢者之石”的旅程。右臂和左腿用鋼制義肢“機(jī)械鎧”來(lái)替代的他，被人們稱(chēng)為“鋼之煉金術(shù)師”…… 　　承接電視版的故事，艾力克兄弟各自在兩個(gè)不同世界生活，想盡辦法期望能再次相見(jiàn)。弟弟艾爾凡斯·艾力克雖然憑著哥哥愛(ài)德華·艾力克的煉成而取回肉身，但失去了四年旅程記憶。他決定跟師傅泉重新修行煉金術(shù)，為找尋哥哥繼續(xù)踏上征途。愛(ài)德華給卷到1923年的德國(guó)慕尼黑，當(dāng)時(shí)一場(chǎng)世界大戰(zhàn)蓄勢(shì)待發(fā)。他嘗試用火箭工學(xué)的力量重返故鄉(xiāng)，但總是找不到頭緒，期間竟重遇宿敵安比，二人展開(kāi)連番激戰(zhàn)。