漁業(yè)飛行員月岡和小林在無人島上的石洞目擊哥斯拉和一隻背面長出長刺的怪獸正在打斗。返回大阪后，二人立刻報(bào)告, 對(duì)策本部立即被成立，并查那一隻長刺的怪獸叫「安基拉斯」，又是和哥斯拉一樣受氫彈試驗(yàn)而蘇醒， 山根博士在沒有兵器對(duì)抗哥斯拉的情況下， 建議用燈光誘導(dǎo)怪獸回海的方法。 　　在燈火管制下，大阪灣出現(xiàn)哥斯拉，防衛(wèi)隊(duì)在灣外發(fā)射照明彈作誘導(dǎo)?？墒牵袔孜磺舴赋檬枭r(shí)逃獄，他們搶了運(yùn)油車。為逃避警方追捕，他們?cè)诖筅媸兄酗w車，由於車速過快，運(yùn)油車失控撞進(jìn)工廠，引發(fā)大爆炸，壤成火災(zāi)，以致哥斯拉向著大阪上陸。破壞大阪上的建筑物，后來更在大阪城跟安基拉斯死斗，哥斯拉最后咬死暴龍安基拉斯，再以放射火焰把安基拉斯火化，哥斯拉回到海中消失身影。 　　轉(zhuǎn)了公司一起到北海道的月岡，在那裡與從前的戰(zhàn)友再次相見。在大阪消失身影的哥斯拉突然在北海道海上被發(fā)現(xiàn)。哥斯拉更在神子島上陸了，轟炸機(jī)趕至并發(fā)動(dòng)全面轟炸，但對(duì)哥斯拉完全沒有效。小林的飛機(jī)被放射熱線打中，接著墮機(jī)犧牲。在那個(gè)事故后引起雪崩的先兆，於是他們就對(duì)哥斯拉展開「雪崩埋沒大作戰(zhàn)」。月岡放出飛彈令雪崩發(fā)生，最后哥斯拉終於被雪和冰淹沒了。 　　由於沒有比核彈更利害的氧破壞劑，令山根博士對(duì)打敗怪獸感到悲傷，再次看出在他眼中只有核彈或氧破壞劑的思想，而忽略借用大自然的力量去對(duì)抗，「雪崩埋沒大作戰(zhàn)」便證明自然力量大於一切，即使一隻無敵怪獸王也輕意被推倒。