根據(jù)同名游戲改編，阿拉斯加Shadow Moses島，高科技部隊“FOXHOUND”與他們帶領(lǐng)的次世代特殊部隊突如其來地起義，占據(jù)了廢棄核子武器研究所。他們自稱“Big Boss的兒子們”對美國政府要求交付Big Boss的遺體。如果24小時以內(nèi)沒有接受的話，就會發(fā)射核彈。 　　美國政府招集原FOXHOUND司令官Roy Campbell上校為鎮(zhèn)壓作戰(zhàn)的司令官?？藏悹柹闲Ｕ屑嗽璅OXHOUND隊員Solid Snake。為了解決這次的恐怖活動，救出2名人質(zhì)。一邊傳達(dá)任務(wù)內(nèi)容，一邊接受各領(lǐng)域的專家們的支持，Snake的單獨(dú)潛入任務(wù)開始了……