衛(wèi)斯理（劉德華），一個(gè)從事跟蹤、調(diào)查神秘事件的男人，是聯(lián)合國(guó)外星生物分析局的特別成員，處理地球上一切和外星生物有關(guān)的事件。一次，衛(wèi)斯理在古董店參觀一塊奇異的藍(lán)色人骨時(shí)，遇到了少時(shí)曾有一面之緣的藍(lán)血人-- 擁有藍(lán)色血液的外星人，「她」的名字叫方天涯（關(guān)芝琳），外表就和一般美女無(wú)異。衛(wèi)斯理正想留住方天涯，這時(shí)附近卻發(fā)生了一宗外星生物突襲事件，美國(guó)的外星生物調(diào)查機(jī)構(gòu)--隸屬FBI的Double X Unit小組 奉命到場(chǎng)，由隊(duì)中精英白素（舒淇）和白奇?zhèn)ィ◤堃珦P(yáng)）兄妹領(lǐng)隊(duì)。白氏兄妹帶領(lǐng)著X組精銳部隊(duì)進(jìn)入事發(fā)大廈，與具有A級(jí)戰(zhàn)斗力的外星生物交戰(zhàn)。衛(wèi)斯理也前來(lái)助陣，無(wú)奈，不敵強(qiáng)大的對(duì)手，身受重傷，而方天涯亦在此時(shí)再次現(xiàn)身，以奇異的力量救了衛(wèi)斯理，殺死了強(qiáng)大的外星怪物。 　　原來(lái)方天涯乃藍(lán)血星人「深藍(lán)[又稱藍(lán)血星]--獵戶星座中最明亮的星體」，六百年前為保護(hù)藍(lán)血圣經(jīng)而離開故鄉(xiāng)，在回程時(shí)遇上了流星雨，天涯便乘逃生倉(cāng)來(lái)到地球，更和弟弟失散，而藍(lán)色的人骨，正是天涯的弟弟tan所有。 　　衛(wèi)斯理受傷昏迷期間，被白氏兄妹所救，而白素在照顧衛(wèi)斯理之時(shí)，竟禁不住對(duì)衛(wèi)暗生情愫，但衛(wèi)斯理的心中記掛的卻是在腦海中留下深刻記憶的方天涯，衛(wèi)斯理遂借X組的最高負(fù)責(zé)人威爾遜之力，動(dòng)用X組中的特異功能人士，以腦電波找尋方天涯的去向，但威爾遜為了在美國(guó)國(guó)會(huì)中得到絕對(duì)的權(quán)力，竟利用衛(wèi)斯理找到方天涯，暗中派人把天涯擄走，并進(jìn)行了一連串不人道的實(shí)驗(yàn)，衛(wèi)斯理抗議無(wú)效，反被軟禁。白氏兄妹看不過(guò)眼欲阻止，卻被威爾遜解除武裝，免去職務(wù) ……. 　　再此同時(shí)，兩名來(lái)自藍(lán)血星的異類生物Kill（鄭浩南）和Rape（黃佩霞）降落地球，原來(lái)本一向和平寧?kù)o的藍(lán)血星，被兇殘?zhí)涨致哉摺斧@殼衣毒間」感染，此刻Kill和Rape到來(lái)，就是想找到藍(lán)血圣經(jīng)，獲得無(wú)窮的力量。Kill和Rape兇殘無(wú)比，他們找到了被X組通緝的大騙子郭博士（王晶），郭眼見性命不保，答應(yīng)帶Kill到X總部找尋方天涯。在小王的領(lǐng)路下，Kill和Rape突然襲擊X總部，將威爾遜和大批X組員殺死，X總部也以自毀爆滅。衛(wèi)斯理、方天涯和白素逃出。 　　衛(wèi)等人回到香港，便和聯(lián)合國(guó)人員與Double X 交涉，要他們交出Tan，從而得知Tan在日本，天涯獲悉后，十分開心，并馬上聯(lián)絡(luò)上Tan，知Tan次日會(huì)到香港會(huì)面，涯聽后情不自禁吻衛(wèi)，二人終爆發(fā)激情，進(jìn)行了一次外星異物和地球人靈與欲的徹底溝通--神交…… 但被白素見到，素傷心不已。 　　次日，Tan突然出現(xiàn)與天涯相見。Tan叫天涯與Rape，Kill合作，交出藍(lán)血圣經(jīng)便可回故鄉(xiāng)，天涯拒之，Tan用計(jì)搶走藍(lán)血圣經(jīng)和天涯，Tan將天涯帶到廢置工廠見Kill和Rape，Tan打算交易…… 　　這時(shí)，小女孩過(guò)腦電波聯(lián)絡(luò)天涯，告知衛(wèi)，天涯深愛著他，衛(wèi)心如刀割。白素趕到，帶來(lái)一批武器，決定和衛(wèi)一同與外星生物決一死戰(zhàn)，營(yíng)救天涯和藍(lán)血圣經(jīng)......