作為寵物小精靈動畫電影的十周年紀念作品，新系列鉆石與珍珠的電影版于今年暑假登陸大銀幕。在本片中，兩大被稱為神的超強口袋妖怪與曾游戲中登場的幻之魔獸將展開一場前所未有的大規(guī)模激戰(zhàn)。 為了參加新一屆口袋妖怪大賽，小智一行人來到了阿拉莫斯鎮(zhèn)。他們在鎮(zhèn)上遇見了一個名叫愛麗斯的漂亮女孩。愛麗斯帶著大家四處游覽。在一座美麗的園林里，小智發(fā)現(xiàn)了可疑的影子。阿爾貝特男爵告訴他們，這是幻之口袋妖怪黑嘯獸。果然如他所言，黑嘯獸出現(xiàn)在大家面前。接著，黑嘯獸再度于廣場現(xiàn)形，用其絕招讓許多人和口袋妖怪陷入沉睡之中。阿爾貝特男爵為了捕獲黑嘯獸派出了突擊隊，卻反而鬧出了大亂子。愛麗斯的好朋友托尼奧是天才建筑家革迪的曾孫。托尼奧在曾祖父的日記中發(fā)現(xiàn)了幾行神秘的預言。正在此時，阿拉莫斯鎮(zhèn)發(fā)生了空間異常，所有的人都被封在了鎮(zhèn)里。原來，空間異常是口袋妖怪帕魯基亞造成的。它在和另一口袋妖怪迪亞路加的大戰(zhàn)中受傷，逃到了這里。黑嘯獸察覺了帕魯基亞的存在，對之展開攻擊。而迪亞路加也追著帕魯基亞從異次元來到這里加入了混戰(zhàn)。阿拉莫斯鎮(zhèn)無法承受這場震動時空的大戰(zhàn)，面臨著毀滅的命運……